Презентация Ферменты гидролиза и биосинтеза нуклеиновых кислот

Смотреть слайды в полном размере
Презентация Ферменты гидролиза и биосинтеза нуклеиновых кислот


Вашему вниманию предлагается презентация «Ферменты гидролиза и биосинтеза нуклеиновых кислот», с которой можно предварительно ознакомиться, просмотреть текст и слайды к ней, а так же, в случае, если она вам подходит - скачать файл для редактирования или печати.

Презентация содержит 21 слайд и доступна для скачивания в формате ppt. Размер скачиваемого файла: 306.50 KB

Просмотреть и скачать

Pic.1
Ферменты гидролиза и биосинтеза нуклеиновых кислот
Ферменты гидролиза и биосинтеза нуклеиновых кислот
Pic.2
Международная классификация ферментов КФ 1 (EC 1): Оксидоредуктазы, катализирующие окисление или вос
Международная классификация ферментов КФ 1 (EC 1): Оксидоредуктазы, катализирующие окисление или восстановление. Примеры: каталаза, алкогольдегидрогеназа КФ 2 (EC 2): Трансферазы, катализирующие перенос химических групп с одной молекулы субстрата на другую. Среди трансфераз особо выделяют киназы, переносящие фосфатную группу, как правило, с молекулы АТФ. КФ 3 (EC 3): Гидролазы, катализирующие гидролиз химических связей. Примеры: эстеразы, пепсин, трипсин, амилаза, липопротеинлипаза КФ 4 (EC 4): Лиазы, катализирующие разрыв химических связей без гидролиза с образованием двойной связи в одном из продуктов. КФ 5 (EC 5): Изомеразы, катализирующие структурные или геометрические изменения в молекуле субстрата. КФ 6 (EC 6): Лигазы, катализирующие образование химических связей между субстратами за счет гидролиза АТФ. Примеры: ДНК-полимераза
Pic.3
Нуклеаза (EC-3) - фермент, расщепляющий нуклеиновые кислоты в живых организмах. Нуклеаза (EC-3) - фе
Нуклеаза (EC-3) - фермент, расщепляющий нуклеиновые кислоты в живых организмах. Нуклеаза (EC-3) - фермент, расщепляющий нуклеиновые кислоты в живых организмах. Нуклеазы участвуют: - в переваривании нуклеиновых кислот пищи; - в удалении чужеродных нуклениновых кислот; и - в регуляции синтеза и распада нуклеиновых кислот в клетках.
Pic.4
Энзиматический гидролиз Экзо- и эндонкулеазы с 3’- или 5’-конца либо по середине цепи Расщепление це
Энзиматический гидролиз Экзо- и эндонкулеазы с 3’- или 5’-конца либо по середине цепи Расщепление цепи по а- и b- типу. продукт 5’-фосфат – а-тип (N-p-N) продукт 3’-фосфат – b-тип (N-p-N) Специфичность к ДНК или РНК ДНазы и РНазы Отношение к фосфату фосфодиэстеразы Фосфомоноэстеразы
Pic.5
Экзонуклеаза
Экзонуклеаза
Pic.6
Эндонуклеазы
Эндонуклеазы
Pic.7
Эндонуклеазы рестрикции (рестриктазы)
Эндонуклеазы рестрикции (рестриктазы)
Pic.8
В 1973 году Смит и Натанс предложили номенклатуру рестриктаз, включающую следующие пункты: 1. Аббрев
В 1973 году Смит и Натанс предложили номенклатуру рестриктаз, включающую следующие пункты: 1. Аббревиатура названия каждого фермента является производной от бинарного названия микроорганизма, содержащего данную метилазно-рестриктазную систему. Составляют по правилу: к первой прописной букве названия рода добавляют две первые строчные буквы вида. Streptomyces albus - Sal, Escherichia coli - Eco 2. В случае необходимости добавляют обозначение серотипа или штамма, например, Есо B. 3. Различные системы рестрикции - модификации, кодируемые одной бактериальной клеткой, обозначают римскими цифрами: Hind II, Hind I, Hind III (Haemophilus influenzae). 4. Рестриктазы обозначают буквой R (R Hind III), метилазы - М (М Hind III). В 1973 году Смит и Натанс предложили номенклатуру рестриктаз, включающую следующие пункты: 1. Аббревиатура названия каждого фермента является производной от бинарного названия микроорганизма, содержащего данную метилазно-рестриктазную систему. Составляют по правилу: к первой прописной букве названия рода добавляют две первые строчные буквы вида. Streptomyces albus - Sal, Escherichia coli - Eco 2. В случае необходимости добавляют обозначение серотипа или штамма, например, Есо B. 3. Различные системы рестрикции - модификации, кодируемые одной бактериальной клеткой, обозначают римскими цифрами: Hind II, Hind I, Hind III (Haemophilus influenzae). 4. Рестриктазы обозначают буквой R (R Hind III), метилазы - М (М Hind III). Открытие новых рестриктаз заставило Робертса в 1978 году внести дополнения в систему рациональных обозначений ферментов: если сокращенное название совпадает для нескольких ферментов, то 2 первые буквы аббревиатуры остаются неизменными, а третья берется из последующих букв видового названия: Haemophilus parainfluenzae - Hpa I Haemophilus parahaemolyticus - Hph I. Изошизомеры – ферменты рестрикции выделенные из разных источников и узнающие одинаковые последовательности.
Pic.9
Рестрикция ДНК и гель-электрофорез рестриктных фрагментов
Рестрикция ДНК и гель-электрофорез рестриктных фрагментов
Pic.10
Ферменты синтеза нуклеиновых кислот ДНК-полимераза РНК-зависимая ДНК полимераза РНК-полимераза Poly(
Ферменты синтеза нуклеиновых кислот ДНК-полимераза РНК-зависимая ДНК полимераза РНК-полимераза Poly(A)-полимераза ДНК-лигаза РНК-лигаза Терминальная трансфераза Полинуклеотидкиназа Щелочная фосфатаза
Pic.11
ДНК-полимераза I (E. coli) Фермент состоит из одной полинуклеотидной цепи (мол. Масса 109 000) облад
ДНК-полимераза I (E. coli) Фермент состоит из одной полинуклеотидной цепи (мол. Масса 109 000) обладающей тремя типами ферментартивной активности.
Pic.12
Большой фрагмент ДНК-полимераза I E. coli (фрагмент Кленова) Фермент состоит из одной полипептидной
Большой фрагмент ДНК-полимераза I E. coli (фрагмент Кленова) Фермент состоит из одной полипептидной цепи (мол. масса 76000), полученной при расщеплении нативной ДНК полимеразы I субтилизином. Обладает 5’-3’ полимеразной активностью и 3’-5’ экзонуклеазной активностью.
Pic.13
ДНК полимераза фага Т4 (из E. coli, инфицированной фагом Т4) Подобно фрагменту Кленова ДНК-полимераз
ДНК полимераза фага Т4 (из E. coli, инфицированной фагом Т4) Подобно фрагменту Кленова ДНК-полимеразы I из E. coli. Обладает 5’-3’ полимеразной активностью и 3’-5’-экзонуклеазной активностью. Однако экзонуклеазная активность ДНК-полимеразы фага Т4 более чем в 200 раз превышает экзонуклеазную активность ДНК-полимеразы I. Реакция обмена. В присутствии только одного dNTP в результате 3’-5’-нуклеазной активности фермента происходит деградация дцДНК, начиная с 3’-ОН-конца до основания, комплементарного внесенному dNTP. Далее с этого места начинается серия реакций синтеза и обмена. Применение Концевое включение метки в фрагмент ДНК с выступающими 5’-концами Концевое включение метки в фрагмент ДНК с тупыми концами или выступающими 5’-концами Включение метки в фрагменты ДНК, используемые в качестве гибридизационных зондов. Определение нуклеотидной последовательности ДНК «плюс-минус» методом
Pic.14
Полинуклеотидкиназа фага Т4 Фермент катализирует перенос -фосфата на 5’-ОН-конец ДНК или РНК Примен
Полинуклеотидкиназа фага Т4 Фермент катализирует перенос -фосфата на 5’-ОН-конец ДНК или РНК Применение Включение метки в 5’-концы ДНК для определения последовательности по методу Максама-Гилберта Фосфорилирование синтетических линкеров и различных фрагментов ДНК, у которых отсутствует концевой 5’-фосфат перед лигирование.
Pic.15
РНК-зависимая ДНК полимераза (обратная транскриптаза) Фермент состоит из двух полипептидов цепей, од
РНК-зависимая ДНК полимераза (обратная транскриптаза) Фермент состоит из двух полипептидов цепей, один из которых обладает и 5’-3’-полимеразной активностью, и специфической по отношению к РНК-ДНК-гибридам двухсторонней рибонуклеазной активностью. Применение: Синтез кДНКдля клонирования (и первой и второй цепи) или для использования в качестве гибридизационных зондов. Концевое включение метки в ДНК с выступающими 5’-концами (реакция достраивания)
Pic.16
Щелочная фосфатаза (из бактерий (BAP), из кишечника теленка (CIP)) Фермент катализирует отщепление 5
Щелочная фосфатаза (из бактерий (BAP), из кишечника теленка (CIP)) Фермент катализирует отщепление 5’-фосфатных остатков ДНК, РНК, рибо- и дезоксирибонуклеозидтрифосфатов. Применение Отщепление 5’-фосфатов от ДНК или РНК перед включением 5’-концевого 32Р Отщепление 5’-фосфатов от фрагментов ДНК для предотвращения сшивания концов одной молекулы.
Pic.17
Poly(A)-полимераза (E. coli) Фермент катализирует присоедиение АМР (полученных из АТР) к свободному
Poly(A)-полимераза (E. coli) Фермент катализирует присоедиение АМР (полученных из АТР) к свободному 3’-ОН-концу РНК Применение Подготовка poly(A)-РНК для клонирования Включение метки в 3’-конец РНК с помощью [a-32Р]АТР для получения гибридизационных зондов
Pic.18
ДНК-лигаза фага Т4 Фермент состоит из одной полипептидной цепи (мол. масса 68000), катализирует обра
ДНК-лигаза фага Т4 Фермент состоит из одной полипептидной цепи (мол. масса 68000), катализирует образование фосфодиэфирной связи между 3’-OH и 5’-фосфатными концами ДНК Применение Сшивание молекул ДНК с совместимыми липкими концами. Сшивание двухцепочечных молекул ДНК с тупыми концами друг с другом или синтетическими линкерами. Активность ДНК-лигазы фага Т4 по отношению к молекулам ДНК с тупами концами может быть повышена примерно в 20 раз при добавлении РНК-лигазы фага Т4
Pic.19
РНК-лигаза фага Т4 Фермент катализирует ковалентное соединение фосфорилированных по 5’-концу одноцеп
РНК-лигаза фага Т4 Фермент катализирует ковалентное соединение фосфорилированных по 5’-концу одноцепочечных ДНК или РНК с одноцепочечными ДНК или РНК имеющими 3’-гидроксильные группы Применение РНК-лигаза фага Т4 повышает эффективность сшивания двухцепочечных молекул ДНК с тупыми концами, катализируемого ДНК-лигазой фага Т4
Pic.20
Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза (из тимуса теленка) Фермент катализирует присоедиение дез
Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза (из тимуса теленка) Фермент катализирует присоедиение дезоксинуклеотидов к 3’-ОН-концу молекулы ДНК. Применеиние Присоединение комплементарных концевых гомополимерных последовательностей к вектору или к кДНК Включение метки в 3’-концы фрагментов ДНК с помощью меченого 32P-3’нуклеозида. Для введения метки в составе рибонуклеозида используют [-32Р]rNTP с последующей обработкой щелочью.
Pic.21
Ферменты гидролиза и биосинтеза нуклеиновых кислот, слайд 21


Скачать презентацию

Если вам понравился сайт и размещенные на нем материалы, пожалуйста, не забывайте поделиться этой страничкой в социальных сетях и с друзьями! Спасибо!